Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SOBPA7XYQ1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOBPA7XYQ1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
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