Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C4orf47A7E2U8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
C4orf47A7E2U8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C4orf47A7E2U8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C4orf47A7E2U8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4orf47A7E2U8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4orf47A7E2U8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4orf47A7E2U8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4orf47A7E2U8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4orf47A7E2U8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4orf47A7E2U8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4orf47A7E2U8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4orf47A7E2U8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C4orf47A7E2U8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C4orf47A7E2U8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C4orf47A7E2U8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4orf47A7E2U8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4orf47A7E2U8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4orf47A7E2U8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4orf47A7E2U8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4orf47A7E2U8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4orf47A7E2U8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C4orf47A7E2U8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C4orf47A7E2U8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4orf47A7E2U8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4orf47A7E2U8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4orf47A7E2U8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4orf47A7E2U8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4orf47A7E2U8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4orf47A7E2U8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C4orf47A7E2U8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
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