Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GOLGA6L4A6NEF3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GOLGA6L4A6NEF3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6L4A6NEF3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms