Protein–RNA interactions for Protein: A6NDZ8

MBD3L4, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L4A6NDZ8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD3L4A6NDZ8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MBD3L4A6NDZ8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD3L4A6NDZ8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD3L4A6NDZ8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD3L4A6NDZ8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD3L4A6NDZ8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD3L4A6NDZ8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD3L4A6NDZ8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD3L4A6NDZ8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD3L4A6NDZ8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD3L4A6NDZ8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD3L4A6NDZ8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD3L4A6NDZ8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD3L4A6NDZ8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD3L4A6NDZ8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD3L4A6NDZ8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD3L4A6NDZ8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD3L4A6NDZ8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD3L4A6NDZ8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD3L4A6NDZ8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD3L4A6NDZ8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD3L4A6NDZ8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD3L4A6NDZ8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD3L4A6NDZ8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD3L4A6NDZ8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD3L4A6NDZ8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD3L4A6NDZ8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD3L4A6NDZ8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms