Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VWA8A3KMH1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWA8A3KMH1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms