Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X4

NR2E3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E3Q9Y5X4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NR2E3Q9Y5X4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NR2E3Q9Y5X4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NR2E3Q9Y5X4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NR2E3Q9Y5X4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NR2E3Q9Y5X4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NR2E3Q9Y5X4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NR2E3Q9Y5X4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NR2E3Q9Y5X4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms