Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y324

FCF1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCF1Q9Y324 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FCF1Q9Y324 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FCF1Q9Y324 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FCF1Q9Y324 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FCF1Q9Y324 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FCF1Q9Y324 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FCF1Q9Y324 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FCF1Q9Y324 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FCF1Q9Y324 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FCF1Q9Y324 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FCF1Q9Y324 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FCF1Q9Y324 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FCF1Q9Y324 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FCF1Q9Y324 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms