Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SRRDQ9UH36 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRRDQ9UH36 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRRDQ9UH36 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRRDQ9UH36 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRRDQ9UH36 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRRDQ9UH36 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRRDQ9UH36 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRRDQ9UH36 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRRDQ9UH36 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRRDQ9UH36 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRRDQ9UH36 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRRDQ9UH36 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRRDQ9UH36 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRRDQ9UH36 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SRRDQ9UH36 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SRRDQ9UH36 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRRDQ9UH36 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRRDQ9UH36 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRRDQ9UH36 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRRDQ9UH36 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRRDQ9UH36 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRRDQ9UH36 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRRDQ9UH36 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SRRDQ9UH36 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRRDQ9UH36 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRRDQ9UH36 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRRDQ9UH36 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SRRDQ9UH36 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRRDQ9UH36 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRRDQ9UH36 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRRDQ9UH36 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRRDQ9UH36 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRRDQ9UH36 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRRDQ9UH36 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRRDQ9UH36 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SRRDQ9UH36 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SRRDQ9UH36 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRRDQ9UH36 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRRDQ9UH36 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRRDQ9UH36 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRRDQ9UH36 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRRDQ9UH36 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRRDQ9UH36 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRRDQ9UH36 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRRDQ9UH36 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRRDQ9UH36 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRRDQ9UH36 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRRDQ9UH36 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRRDQ9UH36 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRRDQ9UH36 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRRDQ9UH36 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRRDQ9UH36 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRRDQ9UH36 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRRDQ9UH36 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRRDQ9UH36 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SRRDQ9UH36 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms