Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC7

ST6GALNAC1, Alpha-N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST6GALNAC1Q9NSC7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ST6GALNAC1Q9NSC7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ST6GALNAC1Q9NSC7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ST6GALNAC1Q9NSC7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ST6GALNAC1Q9NSC7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ST6GALNAC1Q9NSC7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ST6GALNAC1Q9NSC7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ST6GALNAC1Q9NSC7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ST6GALNAC1Q9NSC7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ST6GALNAC1Q9NSC7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ST6GALNAC1Q9NSC7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ST6GALNAC1Q9NSC7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ST6GALNAC1Q9NSC7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ST6GALNAC1Q9NSC7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ST6GALNAC1Q9NSC7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ST6GALNAC1Q9NSC7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ST6GALNAC1Q9NSC7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ST6GALNAC1Q9NSC7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ST6GALNAC1Q9NSC7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ST6GALNAC1Q9NSC7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ST6GALNAC1Q9NSC7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ST6GALNAC1Q9NSC7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ST6GALNAC1Q9NSC7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ST6GALNAC1Q9NSC7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ST6GALNAC1Q9NSC7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ST6GALNAC1Q9NSC7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ST6GALNAC1Q9NSC7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ST6GALNAC1Q9NSC7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ST6GALNAC1Q9NSC7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ST6GALNAC1Q9NSC7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ST6GALNAC1Q9NSC7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ST6GALNAC1Q9NSC7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ST6GALNAC1Q9NSC7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ST6GALNAC1Q9NSC7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms