Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB90

RRAGC, Ras-related GTP-binding protein C, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGCQ9HB90 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRAGCQ9HB90 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRAGCQ9HB90 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRAGCQ9HB90 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RRAGCQ9HB90 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RRAGCQ9HB90 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRAGCQ9HB90 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRAGCQ9HB90 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRAGCQ9HB90 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRAGCQ9HB90 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRAGCQ9HB90 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRAGCQ9HB90 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRAGCQ9HB90 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRAGCQ9HB90 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RRAGCQ9HB90 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRAGCQ9HB90 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRAGCQ9HB90 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRAGCQ9HB90 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRAGCQ9HB90 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRAGCQ9HB90 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RRAGCQ9HB90 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RRAGCQ9HB90 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RRAGCQ9HB90 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
RRAGCQ9HB90 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RRAGCQ9HB90 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RRAGCQ9HB90 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RRAGCQ9HB90 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRAGCQ9HB90 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRAGCQ9HB90 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRAGCQ9HB90 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRAGCQ9HB90 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRAGCQ9HB90 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRAGCQ9HB90 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRAGCQ9HB90 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RRAGCQ9HB90 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRAGCQ9HB90 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRAGCQ9HB90 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRAGCQ9HB90 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRAGCQ9HB90 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RRAGCQ9HB90 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RRAGCQ9HB90 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms