Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SUDS3Q9H7L9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms