Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSS3Q9H6R3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACSS3Q9H6R3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms