Protein–RNA interactions for Protein: Q9H649

NSUN3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN3Q9H649 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSUN3Q9H649 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSUN3Q9H649 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms