Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1X1

RSPH9, Radial spoke head protein 9 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH9Q9H1X1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RSPH9Q9H1X1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RSPH9Q9H1X1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RSPH9Q9H1X1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RSPH9Q9H1X1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RSPH9Q9H1X1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RSPH9Q9H1X1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RSPH9Q9H1X1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RSPH9Q9H1X1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RSPH9Q9H1X1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RSPH9Q9H1X1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RSPH9Q9H1X1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RSPH9Q9H1X1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RSPH9Q9H1X1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RSPH9Q9H1X1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RSPH9Q9H1X1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RSPH9Q9H1X1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.6 ms