Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHACTR1Q9C0D0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PHACTR1Q9C0D0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHACTR1Q9C0D0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms