Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHMP4AQ9BY43 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHMP4AQ9BY43 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHMP4AQ9BY43 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHMP4AQ9BY43 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
CHMP4AQ9BY43 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHMP4AQ9BY43 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHMP4AQ9BY43 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHMP4AQ9BY43 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHMP4AQ9BY43 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHMP4AQ9BY43 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHMP4AQ9BY43 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHMP4AQ9BY43 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHMP4AQ9BY43 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHMP4AQ9BY43 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHMP4AQ9BY43 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHMP4AQ9BY43 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHMP4AQ9BY43 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHMP4AQ9BY43 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHMP4AQ9BY43 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHMP4AQ9BY43 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHMP4AQ9BY43 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHMP4AQ9BY43 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHMP4AQ9BY43 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHMP4AQ9BY43 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHMP4AQ9BY43 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHMP4AQ9BY43 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHMP4AQ9BY43 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHMP4AQ9BY43 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHMP4AQ9BY43 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHMP4AQ9BY43 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHMP4AQ9BY43 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms