Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM208Q9BTX3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.6 ms