Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
ARXQ96QS3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ARXQ96QS3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
ARXQ96QS3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ARXQ96QS3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ARXQ96QS3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ARXQ96QS3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ARXQ96QS3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ARXQ96QS3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ARXQ96QS3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ARXQ96QS3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARXQ96QS3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARXQ96QS3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
ARXQ96QS3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
ARXQ96QS3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ARXQ96QS3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ARXQ96QS3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ARXQ96QS3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ARXQ96QS3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ARXQ96QS3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ARXQ96QS3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ARXQ96QS3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ARXQ96QS3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ARXQ96QS3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ARXQ96QS3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
ARXQ96QS3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
ARXQ96QS3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
ARXQ96QS3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ARXQ96QS3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ARXQ96QS3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ARXQ96QS3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ARXQ96QS3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ARXQ96QS3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ARXQ96QS3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ARXQ96QS3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ARXQ96QS3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
ARXQ96QS3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ARXQ96QS3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ARXQ96QS3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ARXQ96QS3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
ARXQ96QS3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms