Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRC1Q96M27 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms