Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECHDC3Q96DC8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECHDC3Q96DC8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms