Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MKL1Q969V6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MKL1Q969V6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms