Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APPL2Q8NEU8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APPL2Q8NEU8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 781.2 ms