Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BBOF1Q8ND07 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BBOF1Q8ND07 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms