Protein–RNA interactions for Protein: Q53EL6

PDCD4, Programmed cell death protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4Q53EL6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD4Q53EL6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD4Q53EL6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD4Q53EL6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD4Q53EL6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD4Q53EL6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD4Q53EL6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD4Q53EL6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD4Q53EL6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD4Q53EL6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD4Q53EL6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD4Q53EL6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD4Q53EL6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD4Q53EL6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD4Q53EL6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD4Q53EL6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD4Q53EL6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD4Q53EL6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDCD4Q53EL6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PDCD4Q53EL6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD4Q53EL6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms