Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP13A4Q4VNC1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP13A4Q4VNC1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP13A4Q4VNC1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP13A4Q4VNC1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP13A4Q4VNC1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP13A4Q4VNC1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP13A4Q4VNC1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP13A4Q4VNC1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP13A4Q4VNC1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP13A4Q4VNC1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP13A4Q4VNC1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP13A4Q4VNC1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP13A4Q4VNC1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A4Q4VNC1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A4Q4VNC1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A4Q4VNC1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A4Q4VNC1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP13A4Q4VNC1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP13A4Q4VNC1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP13A4Q4VNC1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP13A4Q4VNC1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP13A4Q4VNC1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP13A4Q4VNC1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP13A4Q4VNC1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP13A4Q4VNC1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP13A4Q4VNC1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP13A4Q4VNC1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP13A4Q4VNC1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms