Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C18orf21Q32NC0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C18orf21Q32NC0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms