Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP5B1Q2VPB7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP5B1Q2VPB7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms