Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RRN3P1Q2M238 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RRN3P1Q2M238 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RRN3P1Q2M238 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RRN3P1Q2M238 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RRN3P1Q2M238 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RRN3P1Q2M238 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.3 ms