Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN5AQ14524 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN5AQ14524 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
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