Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX6Q13608 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX6Q13608 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
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