Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPB3Q12988 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 289.3 ms