Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
KCNH2Q12809 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNH2Q12809 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNH2Q12809 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNH2Q12809 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNH2Q12809 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNH2Q12809 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNH2Q12809 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNH2Q12809 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNH2Q12809 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNH2Q12809 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNH2Q12809 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNH2Q12809 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNH2Q12809 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNH2Q12809 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNH2Q12809 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNH2Q12809 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNH2Q12809 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNH2Q12809 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNH2Q12809 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNH2Q12809 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNH2Q12809 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNH2Q12809 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNH2Q12809 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNH2Q12809 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNH2Q12809 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNH2Q12809 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNH2Q12809 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNH2Q12809 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNH2Q12809 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNH2Q12809 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNH2Q12809 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNH2Q12809 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNH2Q12809 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNH2Q12809 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNH2Q12809 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNH2Q12809 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNH2Q12809 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNH2Q12809 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNH2Q12809 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNH2Q12809 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNH2Q12809 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNH2Q12809 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNH2Q12809 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNH2Q12809 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNH2Q12809 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNH2Q12809 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNH2Q12809 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNH2Q12809 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNH2Q12809 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNH2Q12809 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNH2Q12809 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KCNH2Q12809 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
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