Protein–RNA interactions for Protein: Q12765

SCRN1, Secernin-1, humanhuman

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN1Q12765 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCRN1Q12765 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCRN1Q12765 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCRN1Q12765 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCRN1Q12765 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCRN1Q12765 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCRN1Q12765 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCRN1Q12765 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCRN1Q12765 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCRN1Q12765 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SCRN1Q12765 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCRN1Q12765 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCRN1Q12765 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCRN1Q12765 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCRN1Q12765 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCRN1Q12765 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCRN1Q12765 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCRN1Q12765 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCRN1Q12765 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCRN1Q12765 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCRN1Q12765 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCRN1Q12765 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCRN1Q12765 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCRN1Q12765 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCRN1Q12765 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCRN1Q12765 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCRN1Q12765 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCRN1Q12765 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCRN1Q12765 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCRN1Q12765 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCRN1Q12765 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCRN1Q12765 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SCRN1Q12765 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCRN1Q12765 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCRN1Q12765 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCRN1Q12765 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCRN1Q12765 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCRN1Q12765 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCRN1Q12765 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCRN1Q12765 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCRN1Q12765 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCRN1Q12765 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCRN1Q12765 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCRN1Q12765 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SCRN1Q12765 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SCRN1Q12765 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SCRN1Q12765 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCRN1Q12765 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCRN1Q12765 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCRN1Q12765 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
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