Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLEQ07864 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLEQ07864 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLEQ07864 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLEQ07864 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
POLEQ07864 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLEQ07864 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLEQ07864 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLEQ07864 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLEQ07864 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLEQ07864 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLEQ07864 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLEQ07864 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POLEQ07864 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLEQ07864 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLEQ07864 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLEQ07864 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLEQ07864 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLEQ07864 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLEQ07864 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLEQ07864 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLEQ07864 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLEQ07864 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLEQ07864 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLEQ07864 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLEQ07864 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLEQ07864 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLEQ07864 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLEQ07864 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLEQ07864 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLEQ07864 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLEQ07864 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLEQ07864 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLEQ07864 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLEQ07864 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLEQ07864 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLEQ07864 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLEQ07864 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLEQ07864 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLEQ07864 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLEQ07864 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLEQ07864 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLEQ07864 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLEQ07864 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLEQ07864 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLEQ07864 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLEQ07864 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLEQ07864 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLEQ07864 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLEQ07864 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLEQ07864 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLEQ07864 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLEQ07864 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLEQ07864 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLEQ07864 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLEQ07864 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLEQ07864 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLEQ07864 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLEQ07864 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLEQ07864 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLEQ07864 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLEQ07864 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLEQ07864 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLEQ07864 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLEQ07864 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLEQ07864 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLEQ07864 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLEQ07864 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLEQ07864 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLEQ07864 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLEQ07864 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLEQ07864 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLEQ07864 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLEQ07864 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLEQ07864 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLEQ07864 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLEQ07864 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLEQ07864 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLEQ07864 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLEQ07864 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLEQ07864 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLEQ07864 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLEQ07864 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLEQ07864 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLEQ07864 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLEQ07864 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLEQ07864 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLEQ07864 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLEQ07864 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLEQ07864 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLEQ07864 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLEQ07864 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLEQ07864 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLEQ07864 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLEQ07864 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLEQ07864 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLEQ07864 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POLEQ07864 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLEQ07864 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLEQ07864 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms