Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC63Q05C16 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC63Q05C16 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC63Q05C16 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC63Q05C16 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC63Q05C16 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC63Q05C16 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC63Q05C16 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC63Q05C16 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC63Q05C16 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC63Q05C16 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC63Q05C16 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC63Q05C16 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC63Q05C16 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC63Q05C16 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC63Q05C16 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC63Q05C16 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC63Q05C16 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC63Q05C16 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC63Q05C16 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC63Q05C16 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC63Q05C16 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC63Q05C16 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC63Q05C16 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms