Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARF3P61204 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARF3P61204 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARF3P61204 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARF3P61204 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARF3P61204 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARF3P61204 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARF3P61204 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARF3P61204 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARF3P61204 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARF3P61204 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARF3P61204 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF3P61204 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF3P61204 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF3P61204 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF3P61204 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF3P61204 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF3P61204 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF3P61204 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF3P61204 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF3P61204 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF3P61204 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF3P61204 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF3P61204 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF3P61204 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF3P61204 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF3P61204 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF3P61204 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF3P61204 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF3P61204 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF3P61204 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF3P61204 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF3P61204 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF3P61204 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF3P61204 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF3P61204 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF3P61204 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF3P61204 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF3P61204 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF3P61204 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF3P61204 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF3P61204 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF3P61204 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF3P61204 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARF3P61204 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARF3P61204 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARF3P61204 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARF3P61204 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARF3P61204 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARF3P61204 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARF3P61204 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARF3P61204 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARF3P61204 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARF3P61204 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARF3P61204 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARF3P61204 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARF3P61204 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF3P61204 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF3P61204 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF3P61204 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF3P61204 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF3P61204 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF3P61204 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF3P61204 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF3P61204 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF3P61204 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF3P61204 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF3P61204 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARF3P61204 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARF3P61204 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARF3P61204 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARF3P61204 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARF3P61204 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARF3P61204 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARF3P61204 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF3P61204 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF3P61204 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF3P61204 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF3P61204 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF3P61204 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF3P61204 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF3P61204 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF3P61204 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF3P61204 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF3P61204 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF3P61204 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF3P61204 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF3P61204 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF3P61204 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF3P61204 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF3P61204 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARF3P61204 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARF3P61204 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARF3P61204 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARF3P61204 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARF3P61204 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARF3P61204 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ARF3P61204 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARF3P61204 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARF3P61204 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 293.9 ms