Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPD52P55327 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPD52P55327 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPD52P55327 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPD52P55327 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPD52P55327 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPD52P55327 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPD52P55327 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPD52P55327 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPD52P55327 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPD52P55327 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPD52P55327 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPD52P55327 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPD52P55327 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPD52P55327 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPD52P55327 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TPD52P55327 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPD52P55327 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPD52P55327 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPD52P55327 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPD52P55327 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPD52P55327 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPD52P55327 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPD52P55327 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPD52P55327 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPD52P55327 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPD52P55327 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPD52P55327 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPD52P55327 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPD52P55327 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPD52P55327 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPD52P55327 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPD52P55327 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPD52P55327 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPD52P55327 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPD52P55327 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPD52P55327 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPD52P55327 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPD52P55327 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPD52P55327 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPD52P55327 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPD52P55327 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPD52P55327 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPD52P55327 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPD52P55327 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPD52P55327 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPD52P55327 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPD52P55327 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPD52P55327 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPD52P55327 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPD52P55327 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPD52P55327 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPD52P55327 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPD52P55327 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPD52P55327 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPD52P55327 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPD52P55327 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPD52P55327 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPD52P55327 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPD52P55327 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPD52P55327 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TPD52P55327 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPD52P55327 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPD52P55327 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPD52P55327 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPD52P55327 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPD52P55327 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPD52P55327 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPD52P55327 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPD52P55327 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPD52P55327 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPD52P55327 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPD52P55327 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPD52P55327 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPD52P55327 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPD52P55327 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPD52P55327 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TPD52P55327 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPD52P55327 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPD52P55327 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPD52P55327 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPD52P55327 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPD52P55327 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPD52P55327 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TPD52P55327 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPD52P55327 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPD52P55327 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPD52P55327 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPD52P55327 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPD52P55327 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPD52P55327 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPD52P55327 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPD52P55327 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPD52P55327 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPD52P55327 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPD52P55327 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPD52P55327 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPD52P55327 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPD52P55327 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPD52P55327 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms