Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATN1P54259 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATN1P54259 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATN1P54259 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATN1P54259 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATN1P54259 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATN1P54259 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATN1P54259 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATN1P54259 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATN1P54259 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATN1P54259 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATN1P54259 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATN1P54259 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATN1P54259 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATN1P54259 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATN1P54259 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATN1P54259 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATN1P54259 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATN1P54259 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATN1P54259 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATN1P54259 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATN1P54259 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATN1P54259 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATN1P54259 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATN1P54259 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATN1P54259 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATN1P54259 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATN1P54259 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATN1P54259 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATN1P54259 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATN1P54259 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATN1P54259 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ATN1P54259 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATN1P54259 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATN1P54259 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATN1P54259 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ATN1P54259 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATN1P54259 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATN1P54259 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATN1P54259 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATN1P54259 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATN1P54259 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ATN1P54259 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATN1P54259 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATN1P54259 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATN1P54259 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATN1P54259 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATN1P54259 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ATN1P54259 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATN1P54259 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATN1P54259 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATN1P54259 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATN1P54259 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATN1P54259 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATN1P54259 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
ATN1P54259 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATN1P54259 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATN1P54259 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATN1P54259 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATN1P54259 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATN1P54259 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATN1P54259 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ATN1P54259 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ATN1P54259 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATN1P54259 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATN1P54259 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATN1P54259 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATN1P54259 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATN1P54259 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATN1P54259 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATN1P54259 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATN1P54259 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATN1P54259 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ATN1P54259 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATN1P54259 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATN1P54259 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATN1P54259 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATN1P54259 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATN1P54259 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATN1P54259 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATN1P54259 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATN1P54259 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATN1P54259 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATN1P54259 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATN1P54259 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATN1P54259 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATN1P54259 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ATN1P54259 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATN1P54259 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATN1P54259 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATN1P54259 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATN1P54259 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATN1P54259 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATN1P54259 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATN1P54259 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATN1P54259 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATN1P54259 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATN1P54259 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ATN1P54259 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ATN1P54259 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms