Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MRE11P49959 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MRE11P49959 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MRE11P49959 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MRE11P49959 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MRE11P49959 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MRE11P49959 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MRE11P49959 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MRE11P49959 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MRE11P49959 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MRE11P49959 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MRE11P49959 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MRE11P49959 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MRE11P49959 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MRE11P49959 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
MRE11P49959 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MRE11P49959 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MRE11P49959 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MRE11P49959 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MRE11P49959 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MRE11P49959 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MRE11P49959 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MRE11P49959 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MRE11P49959 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MRE11P49959 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MRE11P49959 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MRE11P49959 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MRE11P49959 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MRE11P49959 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MRE11P49959 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MRE11P49959 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MRE11P49959 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MRE11P49959 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MRE11P49959 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MRE11P49959 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MRE11P49959 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MRE11P49959 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MRE11P49959 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MRE11P49959 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MRE11P49959 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MRE11P49959 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MRE11P49959 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
MRE11P49959 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MRE11P49959 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MRE11P49959 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MRE11P49959 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MRE11P49959 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MRE11P49959 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MRE11P49959 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MRE11P49959 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MRE11P49959 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MRE11P49959 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MRE11P49959 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MRE11P49959 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MRE11P49959 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MRE11P49959 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MRE11P49959 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MRE11P49959 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MRE11P49959 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MRE11P49959 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MRE11P49959 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MRE11P49959 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MRE11P49959 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MRE11P49959 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MRE11P49959 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MRE11P49959 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MRE11P49959 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MRE11P49959 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MRE11P49959 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MRE11P49959 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MRE11P49959 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MRE11P49959 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MRE11P49959 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MRE11P49959 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MRE11P49959 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MRE11P49959 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MRE11P49959 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MRE11P49959 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MRE11P49959 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MRE11P49959 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MRE11P49959 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MRE11P49959 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MRE11P49959 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MRE11P49959 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MRE11P49959 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MRE11P49959 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MRE11P49959 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MRE11P49959 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MRE11P49959 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MRE11P49959 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MRE11P49959 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MRE11P49959 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MRE11P49959 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MRE11P49959 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MRE11P49959 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MRE11P49959 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MRE11P49959 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MRE11P49959 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MRE11P49959 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MRE11P49959 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1120.3 ms