Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSNK1DP48730 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSNK1DP48730 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSNK1DP48730 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSNK1DP48730 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSNK1DP48730 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSNK1DP48730 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSNK1DP48730 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CSNK1DP48730 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.9 ms