Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP214P35658 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP214P35658 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP214P35658 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP214P35658 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP214P35658 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP214P35658 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP214P35658 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP214P35658 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP214P35658 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP214P35658 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP214P35658 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP214P35658 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP214P35658 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP214P35658 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP214P35658 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP214P35658 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP214P35658 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP214P35658 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP214P35658 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP214P35658 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP214P35658 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP214P35658 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP214P35658 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP214P35658 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP214P35658 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP214P35658 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP214P35658 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP214P35658 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP214P35658 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP214P35658 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP214P35658 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP214P35658 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP214P35658 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP214P35658 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP214P35658 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP214P35658 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP214P35658 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP214P35658 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP214P35658 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP214P35658 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP214P35658 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP214P35658 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP214P35658 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP214P35658 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP214P35658 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP214P35658 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP214P35658 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP214P35658 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP214P35658 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP214P35658 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP214P35658 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP214P35658 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP214P35658 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP214P35658 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP214P35658 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP214P35658 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP214P35658 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP214P35658 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP214P35658 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP214P35658 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP214P35658 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP214P35658 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP214P35658 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP214P35658 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP214P35658 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP214P35658 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP214P35658 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP214P35658 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP214P35658 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP214P35658 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP214P35658 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP214P35658 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP214P35658 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP214P35658 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP214P35658 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP214P35658 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP214P35658 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP214P35658 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP214P35658 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP214P35658 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP214P35658 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP214P35658 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP214P35658 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP214P35658 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP214P35658 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP214P35658 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP214P35658 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP214P35658 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP214P35658 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP214P35658 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP214P35658 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP214P35658 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP214P35658 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP214P35658 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP214P35658 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP214P35658 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP214P35658 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUP214P35658 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUP214P35658 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms