Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSMB4P28070 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMB4P28070 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMB4P28070 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMB4P28070 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMB4P28070 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMB4P28070 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMB4P28070 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMB4P28070 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMB4P28070 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMB4P28070 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMB4P28070 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMB4P28070 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMB4P28070 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMB4P28070 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMB4P28070 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMB4P28070 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMB4P28070 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMB4P28070 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMB4P28070 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMB4P28070 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMB4P28070 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMB4P28070 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMB4P28070 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMB4P28070 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMB4P28070 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMB4P28070 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMB4P28070 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMB4P28070 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms