Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDCP20941 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDCP20941 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDCP20941 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PDCP20941 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PDCP20941 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDCP20941 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDCP20941 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDCP20941 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDCP20941 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDCP20941 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDCP20941 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDCP20941 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDCP20941 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDCP20941 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDCP20941 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDCP20941 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDCP20941 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PDCP20941 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PDCP20941 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDCP20941 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDCP20941 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDCP20941 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDCP20941 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDCP20941 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDCP20941 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDCP20941 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDCP20941 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDCP20941 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDCP20941 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDCP20941 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PDCP20941 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PDCP20941 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDCP20941 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDCP20941 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDCP20941 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDCP20941 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDCP20941 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDCP20941 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDCP20941 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDCP20941 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDCP20941 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDCP20941 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDCP20941 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDCP20941 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDCP20941 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDCP20941 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDCP20941 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDCP20941 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDCP20941 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDCP20941 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PDCP20941 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDCP20941 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDCP20941 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDCP20941 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDCP20941 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDCP20941 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDCP20941 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDCP20941 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDCP20941 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDCP20941 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDCP20941 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PDCP20941 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDCP20941 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDCP20941 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PDCP20941 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDCP20941 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDCP20941 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PDCP20941 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PDCP20941 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDCP20941 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDCP20941 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDCP20941 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDCP20941 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDCP20941 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDCP20941 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDCP20941 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDCP20941 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDCP20941 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDCP20941 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDCP20941 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDCP20941 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDCP20941 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDCP20941 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDCP20941 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDCP20941 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDCP20941 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDCP20941 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDCP20941 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDCP20941 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDCP20941 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PDCP20941 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDCP20941 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDCP20941 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDCP20941 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDCP20941 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDCP20941 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDCP20941 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDCP20941 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDCP20941 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms