Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC9A1P19634 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9A1P19634 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms