Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI3P19429 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms