Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF35P13682 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF35P13682 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF35P13682 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF35P13682 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF35P13682 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF35P13682 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF35P13682 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF35P13682 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF35P13682 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF35P13682 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF35P13682 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF35P13682 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF35P13682 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF35P13682 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF35P13682 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF35P13682 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF35P13682 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF35P13682 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF35P13682 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF35P13682 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF35P13682 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF35P13682 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF35P13682 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF35P13682 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF35P13682 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF35P13682 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF35P13682 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF35P13682 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF35P13682 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF35P13682 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF35P13682 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF35P13682 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF35P13682 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF35P13682 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF35P13682 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF35P13682 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF35P13682 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF35P13682 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF35P13682 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF35P13682 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF35P13682 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF35P13682 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF35P13682 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF35P13682 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF35P13682 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF35P13682 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF35P13682 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF35P13682 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF35P13682 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF35P13682 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF35P13682 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF35P13682 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms