Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
U2AF1L5P0DN76 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
U2AF1L5P0DN76 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
U2AF1L5P0DN76 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
U2AF1L5P0DN76 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
U2AF1L5P0DN76 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
U2AF1L5P0DN76 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
U2AF1L5P0DN76 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
U2AF1L5P0DN76 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
U2AF1L5P0DN76 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
U2AF1L5P0DN76 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
U2AF1L5P0DN76 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
U2AF1L5P0DN76 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
U2AF1L5P0DN76 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
U2AF1L5P0DN76 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
U2AF1L5P0DN76 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
U2AF1L5P0DN76 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
U2AF1L5P0DN76 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
U2AF1L5P0DN76 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
U2AF1L5P0DN76 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
U2AF1L5P0DN76 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
U2AF1L5P0DN76 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
U2AF1L5P0DN76 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
U2AF1L5P0DN76 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
U2AF1L5P0DN76 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
U2AF1L5P0DN76 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
U2AF1L5P0DN76 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
U2AF1L5P0DN76 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
U2AF1L5P0DN76 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
U2AF1L5P0DN76 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
U2AF1L5P0DN76 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
U2AF1L5P0DN76 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
U2AF1L5P0DN76 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
U2AF1L5P0DN76 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
U2AF1L5P0DN76 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
U2AF1L5P0DN76 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
U2AF1L5P0DN76 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
U2AF1L5P0DN76 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
U2AF1L5P0DN76 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
U2AF1L5P0DN76 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
U2AF1L5P0DN76 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
U2AF1L5P0DN76 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
U2AF1L5P0DN76 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
U2AF1L5P0DN76 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
U2AF1L5P0DN76 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
U2AF1L5P0DN76 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
U2AF1L5P0DN76 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
U2AF1L5P0DN76 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
U2AF1L5P0DN76 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
U2AF1L5P0DN76 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
U2AF1L5P0DN76 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
U2AF1L5P0DN76 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
U2AF1L5P0DN76 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
U2AF1L5P0DN76 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
U2AF1L5P0DN76 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
U2AF1L5P0DN76 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
U2AF1L5P0DN76 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
U2AF1L5P0DN76 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
U2AF1L5P0DN76 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
U2AF1L5P0DN76 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
U2AF1L5P0DN76 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
U2AF1L5P0DN76 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
U2AF1L5P0DN76 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
U2AF1L5P0DN76 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
U2AF1L5P0DN76 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
U2AF1L5P0DN76 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
U2AF1L5P0DN76 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
U2AF1L5P0DN76 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
U2AF1L5P0DN76 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
U2AF1L5P0DN76 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
U2AF1L5P0DN76 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms