Protein–RNA interactions for Protein: P08779

KRT16, Keratin, type I cytoskeletal 16, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT16P08779 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT16P08779 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT16P08779 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT16P08779 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT16P08779 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT16P08779 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT16P08779 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT16P08779 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT16P08779 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT16P08779 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT16P08779 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT16P08779 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT16P08779 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT16P08779 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT16P08779 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT16P08779 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT16P08779 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT16P08779 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT16P08779 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT16P08779 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT16P08779 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT16P08779 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT16P08779 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT16P08779 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT16P08779 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT16P08779 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT16P08779 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT16P08779 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT16P08779 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT16P08779 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT16P08779 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT16P08779 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT16P08779 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT16P08779 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT16P08779 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT16P08779 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT16P08779 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT16P08779 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT16P08779 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT16P08779 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT16P08779 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT16P08779 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT16P08779 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT16P08779 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT16P08779 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT16P08779 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT16P08779 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT16P08779 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT16P08779 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT16P08779 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT16P08779 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT16P08779 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT16P08779 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT16P08779 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT16P08779 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT16P08779 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT16P08779 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT16P08779 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT16P08779 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT16P08779 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT16P08779 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT16P08779 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT16P08779 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT16P08779 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT16P08779 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT16P08779 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT16P08779 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT16P08779 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT16P08779 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT16P08779 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT16P08779 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT16P08779 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT16P08779 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT16P08779 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT16P08779 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT16P08779 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT16P08779 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT16P08779 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT16P08779 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT16P08779 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT16P08779 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT16P08779 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT16P08779 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT16P08779 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT16P08779 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT16P08779 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT16P08779 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT16P08779 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT16P08779 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT16P08779 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT16P08779 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT16P08779 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT16P08779 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT16P08779 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT16P08779 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT16P08779 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT16P08779 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT16P08779 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT16P08779 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT16P08779 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.8 ms