Protein–RNA interactions for Protein: P08134

RHOC, Rho-related GTP-binding protein RhoC, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOCP08134 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOCP08134 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOCP08134 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOCP08134 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOCP08134 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOCP08134 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOCP08134 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOCP08134 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOCP08134 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOCP08134 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOCP08134 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOCP08134 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOCP08134 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOCP08134 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOCP08134 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOCP08134 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RHOCP08134 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RHOCP08134 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RHOCP08134 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOCP08134 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOCP08134 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOCP08134 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOCP08134 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOCP08134 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOCP08134 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOCP08134 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOCP08134 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOCP08134 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOCP08134 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOCP08134 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOCP08134 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOCP08134 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOCP08134 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOCP08134 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOCP08134 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOCP08134 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOCP08134 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOCP08134 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOCP08134 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOCP08134 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOCP08134 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOCP08134 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOCP08134 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOCP08134 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOCP08134 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOCP08134 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOCP08134 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
RHOCP08134 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOCP08134 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOCP08134 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOCP08134 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOCP08134 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOCP08134 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOCP08134 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOCP08134 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOCP08134 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOCP08134 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOCP08134 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOCP08134 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOCP08134 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOCP08134 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOCP08134 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOCP08134 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOCP08134 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOCP08134 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOCP08134 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOCP08134 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOCP08134 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOCP08134 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOCP08134 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOCP08134 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOCP08134 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOCP08134 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOCP08134 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOCP08134 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOCP08134 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOCP08134 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOCP08134 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOCP08134 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOCP08134 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOCP08134 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOCP08134 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOCP08134 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOCP08134 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RHOCP08134 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RHOCP08134 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOCP08134 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOCP08134 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOCP08134 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOCP08134 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOCP08134 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOCP08134 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOCP08134 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOCP08134 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOCP08134 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOCP08134 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOCP08134 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOCP08134 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOCP08134 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOCP08134 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms