Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD5O60279 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD5O60279 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD5O60279 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms